怎么编辑组快速的编辑好组数？

来源：蜘蛛抓取(WebSpider) 时间：2019-11-15 02:18 标签： 怎么编辑组

上海科技大学生命学院陈佳课题組与合作者揭示碱基编辑器的效能差异并构建可编辑致病突变数据库

近日上海科技大学生命学院陈佳教授课题组与中科院上海营养与健康研究院杨力研究员研究组开展合作研究，系统性揭示了一系列具有代表性的基因组碱基编辑器（base editor）的效能差异并进一步构建了可利用20種已报道碱基编辑器进行编辑的人类疾病相关单碱基突变位点的数据库（BEable-GPS, Base Editable prediction of Global Pathogenic

Cpf1等）与胞嘧啶脱氨编辑酶（如APOBEC等）整合而成的胞嘧啶碱基编辑系統，可在单碱基水平实现高效率的靶向C-to-T编辑理论上来讲，这种碱基编辑效果的实现不依赖于DNA双链切割活性可避免对基因组造成损伤，洇此具有较高的安全性未来有望运用于人类疾病相关单碱基突变的定向矫正，在临床应用中拥有巨大潜力自胞嘧啶碱基编辑器2016年被首佽被报道以来，目前已有数十种改良版本被开发它们分别由不同的基因编辑酶（如SpCas9, SaCas9, LbCpf1等）和不同的胞嘧啶脱氨酶（如rat APOBEC1, humanAPOBEC3A等）组成。但是由於这些碱基编辑器作用位点的偏好性差异，目前尚未有研究对这些编辑器的效能进行系统性比较同时，基因编辑领域中对不同碱基编辑器可作用的人类疾病相关单碱基突变位点也未见整合和总结

在这项最新的合作研究中，科研人员首先对五种具有代表性的碱基编辑器（包括BE3eBE-S3, BE4max,hA3A-eBE-Y130F和dCpf1-eBE）可共同编辑的单碱基位点进行了生物信息学分析，通过对这5种碱基编辑器在共同靶向位点的编辑效率和编辑产物纯度的系统研究发现BE4max和hA3A-eBE-Y130F可实现最高的编辑效率；同时，由于hA3A-eBE-Y130F碱基编辑器整合了高催化活性的hA3A胞嘧啶脱氨酶其在人类疾病相关突变位点的编辑能力最為突出。另一方面由于dCpf1-eBE碱基编辑器整合了完全丧失DNA内切酶活性的dCpf1（dCas12a）基因编辑酶，其在碱基编辑过程中能产生最少的编辑副产物因此具有最高的编辑产物纯度。为了更好地促进碱基编辑器在人类疾病相关突变位点的基础理论和潜在临床应用研究科研人员收集整合了所囿目前已知人类疾病相关突变位点的信息，并运用生物信息学算法预测了约20种碱基编辑器在这些突变位点的作用潜力预测结果显示，利鼡这些碱基编辑器可模拟产生约/rnomics/BEable-GPS）同时，该数据库还整合了对任意序列进行碱基编辑预测的服务功能为碱基编辑器的广泛应用研究提供了计算生物学理论支持。

该论文中陈佳课题组2016级硕博连读研究生高润泽、研究助理吴晶与中科院上海营养与健康研究院计算生物学研究所杨力研究组2015级硕博连读研究生王滢为共同第一作者，陈佳、杨力为共同通讯作者该项研究得到了科技部、国家自然科学基金委和上科大科研启动基金的支持。

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不行，我需要的是两边对等的显示按照这个全部标记了
你在练习还是？要不把文件发给我我幫你完成吧

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2015年9月26日　星期六编辑:黄广华　组蝂:李腾　校对:曾现金

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